MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium marinum M chromosome

Total Repeats: 13817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010612	GTGCG	2	10	6501206	6501215	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13502	NC_010612	GCC	2	6	6503225	6503230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13503	NC_010612	GAC	2	6	6507863	6507868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_010612	GCC	2	6	6508044	6508049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13505	NC_010612	GAG	2	6	6508092	6508097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_010612	CGACGC	2	12	6508113	6508124	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13507	NC_010612	GAC	2	6	6509070	6509075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_010612	ACCC	2	8	6509100	6509107	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13509	NC_010612	C	6	6	6509105	6509110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13510	NC_010612	GTC	2	6	6509131	6509136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_010612	AC	3	6	6509185	6509190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13512	NC_010612	GCG	2	6	6510863	6510868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_010612	GCCG	2	8	6511677	6511684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13514	NC_010612	TCC	2	6	6512493	6512498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13515	NC_010612	CGGC	2	8	6514078	6514085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13516	NC_010612	TGC	2	6	6514870	6514875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_010612	CAG	2	6	6514896	6514901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_010612	ACT	2	6	6520913	6520918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_010612	CGCGT	2	10	6520933	6520942	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13520	NC_010612	GC	3	6	6522783	6522788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13521	NC_010612	GGTGC	2	10	6522806	6522815	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13522	NC_010612	CCGG	2	8	6522910	6522917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13523	NC_010612	TCG	3	9	6522970	6522978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_010612	GCG	2	6	6523003	6523008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_010612	CGC	2	6	6523013	6523018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13526	NC_010612	CA	3	6	6524673	6524678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13527	NC_010612	CGG	2	6	6524686	6524691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_010612	CCA	2	6	6524716	6524721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13529	NC_010612	GGGCCA	2	12	6525569	6525580	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_010612	CG	3	6	6525594	6525599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13531	NC_010612	GGC	2	6	6525604	6525609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_010612	ACGT	2	8	6525633	6525640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13533	NC_010612	GT	3	6	6526900	6526905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_010612	CCGGC	2	10	6526943	6526952	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13535	NC_010612	CG	3	6	6529579	6529584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13536	NC_010612	TGGGT	2	10	6529641	6529650	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_010612	GTCG	2	8	6529677	6529684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13538	NC_010612	CCA	2	6	6529714	6529719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13539	NC_010612	CCG	2	6	6529724	6529729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13540	NC_010612	GAC	2	6	6529793	6529798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_010612	GACC	2	8	6529810	6529817	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13542	NC_010612	CCG	2	6	6529837	6529842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13543	NC_010612	CGC	2	6	6529854	6529859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13544	NC_010612	GCG	2	6	6530209	6530214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_010612	ACT	2	6	6530238	6530243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_010612	GAAG	2	8	6530292	6530299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_010612	GCG	2	6	6530971	6530976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_010612	CCG	2	6	6531032	6531037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13549	NC_010612	CG	3	6	6531702	6531707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13550	NC_010612	GCC	2	6	6531725	6531730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13551	NC_010612	GC	3	6	6531751	6531756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13552	NC_010612	GCCCG	2	10	6531837	6531846	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13553	NC_010612	ACC	2	6	6532678	6532683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13554	NC_010612	TCG	2	6	6532694	6532699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_010612	CCCG	2	8	6532709	6532716	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13556	NC_010612	CCG	2	6	6532737	6532742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13557	NC_010612	CCG	2	6	6532778	6532783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13558	NC_010612	CCG	2	6	6532816	6532821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13559	NC_010612	GCA	2	6	6532826	6532831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_010612	TCG	2	6	6532952	6532957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_010612	GGC	2	6	6532960	6532965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_010612	GTT	2	6	6533017	6533022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_010612	AGCG	2	8	6533571	6533578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13564	NC_010612	CGCA	2	8	6533579	6533586	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13565	NC_010612	GGC	2	6	6533613	6533618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_010612	AGGCG	2	10	6534627	6534636	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13567	NC_010612	GAC	2	6	6534637	6534642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13568	NC_010612	ATG	2	6	6534658	6534663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_010612	CG	3	6	6537225	6537230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13570	NC_010612	GGT	2	6	6540629	6540634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_010612	TG	4	8	6540648	6540655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_010612	GTC	2	6	6540720	6540725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13573	NC_010612	CCG	2	6	6541014	6541019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13574	NC_010612	GC	3	6	6541044	6541049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13575	NC_010612	GTC	2	6	6541052	6541057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13576	NC_010612	TGC	2	6	6541058	6541063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13577	NC_010612	GAT	2	6	6541083	6541088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_010612	C	6	6	6541134	6541139	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13579	NC_010612	GTC	2	6	6541142	6541147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13580	NC_010612	CGC	2	6	6541193	6541198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13581	NC_010612	GGA	2	6	6541210	6541215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13582	NC_010612	GCGG	2	8	6542937	6542944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13583	NC_010612	AGG	2	6	6542946	6542951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_010612	CGGT	2	8	6543007	6543014	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13585	NC_010612	GC	3	6	6543031	6543036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13586	NC_010612	AAC	2	6	6543980	6543985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13587	NC_010612	TAC	2	6	6544170	6544175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_010612	ACG	2	6	6544286	6544291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13589	NC_010612	TGT	2	6	6544325	6544330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_010612	CAG	2	6	6550391	6550396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13591	NC_010612	CAG	2	6	6550417	6550422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13592	NC_010612	GAT	2	6	6550497	6550502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_010612	CCG	2	6	6550705	6550710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13594	NC_010612	CGA	2	6	6550723	6550728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13595	NC_010612	CA	3	6	6550800	6550805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13596	NC_010612	ACG	2	6	6550891	6550896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13597	NC_010612	TAGC	2	8	6550995	6551002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13598	NC_010612	GACC	2	8	6551014	6551021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13599	NC_010612	AC	3	6	6551063	6551068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13600	NC_010612	CCG	2	6	6551115	6551120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13601	NC_010612	TTG	2	6	6551175	6551180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_010612	AC	3	6	6551190	6551195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13603	NC_010612	ATC	2	6	6551416	6551421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13604	NC_010612	ATA	2	6	6551436	6551441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_010612	CGG	2	6	6551450	6551455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13606	NC_010612	CGAGC	2	10	6551514	6551523	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13607	NC_010612	GCA	2	6	6551540	6551545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_010612	ATTCC	2	10	6552840	6552849	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13609	NC_010612	CCA	2	6	6552889	6552894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13610	NC_010612	CCA	2	6	6552901	6552906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13611	NC_010612	AGATC	2	10	6552928	6552937	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13612	NC_010612	AG	3	6	6552942	6552947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_010612	CGT	2	6	6554219	6554224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_010612	GAGAG	2	10	6554258	6554267	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_010612	TCC	2	6	6555383	6555388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13616	NC_010612	CGT	2	6	6555410	6555415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13617	NC_010612	CGG	2	6	6555418	6555423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13618	NC_010612	CGC	2	6	6555424	6555429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13619	NC_010612	CAG	2	6	6555450	6555455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_010612	GTT	2	6	6556735	6556740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_010612	GC	3	6	6556796	6556801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13622	NC_010612	CGG	2	6	6556802	6556807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13623	NC_010612	TGC	2	6	6556924	6556929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_010612	GTT	2	6	6556968	6556973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_010612	GGT	2	6	6557015	6557020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_010612	CGA	2	6	6557068	6557073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13627	NC_010612	GGC	2	6	6559841	6559846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13629	NC_010612	GGT	2	6	6559889	6559894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13759	NC_010612	CGG	2	6	6608052	6608057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13760	NC_010612	AAC	2	6	6608067	6608072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13761	NC_010612	GC	3	6	6609313	6609318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13762	NC_010612	CCGC	2	8	6609340	6609347	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13763	NC_010612	CAG	2	6	6609431	6609436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13764	NC_010612	AC	3	6	6609487	6609492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13765	NC_010612	AGT	2	6	6609505	6609510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13767	NC_010612	GC	4	8	6609647	6609654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13768	NC_010612	CTC	2	6	6609658	6609663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13773	NC_010612	TCC	2	6	6613391	6613396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13776	NC_010612	CGG	2	6	6615588	6615593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13780	NC_010612	GCG	2	6	6615721	6615726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13782	NC_010612	CGG	2	6	6615807	6615812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13786	NC_010612	CG	3	6	6618299	6618304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13787	NC_010612	CGGC	2	8	6618377	6618384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13788	NC_010612	CCA	2	6	6621580	6621585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13789	NC_010612	CCGC	2	8	6621613	6621620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13790	NC_010612	CGGG	2	8	6625890	6625897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13791	NC_010612	GCGG	2	8	6626713	6626720	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13792	NC_010612	CAG	2	6	6626724	6626729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13793	NC_010612	CAC	2	6	6628141	6628146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13794	NC_010612	AATT	2	8	6628208	6628215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13795	NC_010612	GCA	2	6	6630279	6630284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13796	NC_010612	GCC	2	6	6630308	6630313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13797	NC_010612	CGT	2	6	6630321	6630326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13798	NC_010612	CTC	2	6	6630351	6630356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13799	NC_010612	AG	3	6	6630449	6630454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13800	NC_010612	C	7	7	6630532	6630538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13801	NC_010612	GCCG	2	8	6630546	6630553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13802	NC_010612	CGC	2	6	6630579	6630584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13804	NC_010612	GGAT	2	8	6630657	6630664	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13805	NC_010612	CGGC	2	8	6633533	6633540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13806	NC_010612	CTT	2	6	6633581	6633586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13809	NC_010612	GC	3	6	6634321	6634326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13810	NC_010612	CGA	2	6	6635759	6635764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13811	NC_010612	AACC	2	8	6636323	6636330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13812	NC_010612	GCC	2	6	6636332	6636337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13813	NC_010612	GGT	2	6	6636360	6636365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13814	NC_010612	ACCC	2	8	6636491	6636498	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13815	NC_010612	ACC	2	6	6636533	6636538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13816	NC_010612	CGG	2	6	6636630	6636635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.